A ce même moment, au petit séminaire de PLOUGERNEVEL, le nombre d'élèves, internes et demi-pensionnaires, devait dépasser les 400. L'établissement comportait alors une école primaire qui, au fil des années, s'ouvrait de plus en plus à des jeunes qui n'avaient pas la vocation religieuse.

Au dehors les persécutions font rages. La laïcisation à outrance frappe tout autour du pensionnat.

Le 27 avril 1906, la Supérieure de GOUAREC soumet le projet d'ouvrir dans le pensionnat un cours d'Apprentissage Ménager qui permettrait, l'œuvre scolaire interdite, de conserver les grands élèves et de parer au déficit qui allait inévitablement se produire dans le budget du fait de la fermeture des classes. Cette école ménagère serait dirigées par 2 anciennes élèves : Jeanne Quilgars et J.M. Courtois que la Communauté enverrait suivre des cours de l'Institut Normal Ménager à Paris.
Au mois d'août, après la visite de la directrice de l'Institut Normal Ménager de Paris et sur ses insistances, 4 sœurs sont envoyées à Paris pour suivre les cours.
Les locaux destinés au cours furent aménagés et à la rentrée d'octobre 12 grandes élèves les suivirent.

Le petit séminaire de Plouguernével

Suite à la loi de séparation de l'Eglise et de l'Etat en 1905, le séminaire de Plouguernevel et les fermes lui appartenant devinrent propriété de l'Etat et malgré les importantes résistances, le 19 décembre 1906, le supérieur, les professeurs et les élèves sont expulsés des locaux et dispersés par la force publique.

En 1907, la communauté de GOUAREC vit dans l'angoisse. Les décrets de fermeture faisaient chaque jour de nouvelles victimes. Du moins l'Ecole Ménagère échappait à ces lois. De grandes jeunes filles d'un peu partout demandèrent à suivre les cours. Fut créé, pour elles, le mois ménager. Elles venaient tous les jeudis durant quelques mois, parcouraient le programme en 16 leçons.

Le 6 juin 1908 Clémenceau signe l'arrêté ordonnant la fermeture du pensionnat en exécution de la loi Combes du 7 juillet 1904 ainsi conçue : " l'enseignement de tout ordre et de toute nature est interdit en France aux congrégations ".
Le 7 juin 1908, la Mère Supérieure recevait officiellement l'arrêt de fermeture des classes. Les 200 élèves quittent définitivement leur école. Seul subsiste l'Ecole Ménagère qui échappait, elle, aux lois.
A la fin de septembre l'un des préaux du Pensionnat, devenant inoccupé par suite de fermeture de classe, est transformé en salle de repassage et lessivage pour les cours ménagers.